隨著生命科學(xué)和計(jì)算機(jī)科學(xué)的飛速發(fā)展,生物信息學(xué)作為兩者相結(jié)合的一門(mén)新學(xué)科,已廣泛應(yīng)用于生命科學(xué)的多個(gè)領(lǐng)域,成為解決科學(xué)問(wèn)題的一個(gè)重要工具??蒲泄ぷ髡邆兙哂袑I(yè)的背景,然而如何運(yùn)用生物信息學(xué)服務(wù)解決科學(xué)問(wèn)題,是大家都面臨的問(wèn)題。豐核信息為廣大科研工作者提供專業(yè)的生物信息服務(wù),與您一起解決科學(xué)問(wèn)題。
一、服務(wù)介紹
近幾年,實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)不斷積累并存儲(chǔ)在公用數(shù)據(jù)庫(kù)中,可供廣大科研工作者下載使用。因此,對(duì)這些數(shù)據(jù)進(jìn)行整理,并進(jìn)一步深度挖掘,已成為一個(gè)重要研究方法。
二、服務(wù)流程
1、客戶提供研究方向
2、生信工程師提供分析提綱
3、反饋溝通
4、進(jìn)行數(shù)據(jù)分析
5、出具分析報(bào)告
三、研究案例展示(芯片分析)
研究背景
肝癌可以分為三種類(lèi)型:肝細(xì)胞癌、膽管細(xì)胞性肝癌和混合性肝癌。本研究的目的是為了尋找這三種肝癌基因表達(dá)情況的不同點(diǎn)和相同點(diǎn)。
研究策略
1 從NCBI GEO數(shù)據(jù)庫(kù)中下載轉(zhuǎn)錄表達(dá)譜,包括70張肝細(xì)胞癌芯片,13張膽管細(xì)胞性肝癌芯片和7張混合性肝癌芯片。
2 對(duì)三種類(lèi)型的肝癌進(jìn)行兩兩比較,尋找差異基因。
3 蛋白互作網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建,聚類(lèi)分析,MCODE分析,GSEA富集分析